前身系江苏省儿童保健中心（位于南京医科大学第二附属医院内），是集科研、临床、教学、培训、基层指导为一体的国内知名儿童保健机构。2005年3月由省卫生厅安排整体转入江苏省妇幼卫生保健中心。承担对省内各级儿童保健专业人员的业务培训、技术指导，参与相关的技术标准和规范要求的制定等。开展普通儿童保健、儿童生长发育、儿童心理与早期教育、儿童眼保健、儿童口腔保健等门诊服务。